libStatGen Software 1
SamTags Member List

This is the complete list of members for SamTags, including all inherited members.

BQ_TAG (defined in SamTags)SamTagsstatic
BQ_TAG_TYPE (defined in SamTags)SamTagsstatic
createMDTag(String &outputMDtag, SamRecord &inputRec, GenomeSequence &genome)SamTagsstatic
isMDTagCorrect(SamRecord &inputRec, GenomeSequence &genome)SamTagsstatic
MD_TAG (defined in SamTags)SamTagsstatic
MD_TAG_TYPE (defined in SamTags)SamTagsstatic
ORIG_CIGAR_TAG (defined in SamTags)SamTagsstatic
ORIG_CIGAR_TAG_TYPE (defined in SamTags)SamTagsstatic
ORIG_POS_TAG (defined in SamTags)SamTagsstatic
ORIG_POS_TAG_TYPE (defined in SamTags)SamTagsstatic
ORIG_QUAL_TAG (defined in SamTags)SamTagsstatic
ORIG_QUAL_TAG_TYPE (defined in SamTags)SamTagsstatic
updateMDTag(SamRecord &inputRec, GenomeSequence &genome) (defined in SamTags)SamTagsstatic